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• Protein Data Bank ｜ 3DB Browser
• NTP Chemical Structures from Published Technical Reports
• Database of Macromolecular Movements
• 国立医薬品食品衛生研究所［旧・国立衛生試験所］
  • 国際化学物質安全性カード（ICSC）
  • 環境保健クライテリア（EHC）の抄訳
  • 内分泌攪乱物質関連資料で取り上げられている農薬（ICSCデータ等へリンク）
• 医薬品分子データベース（東京薬科大学薬学部・第二薬化学教室）
• JST化学物質データベース（生体影響DB研究用）
• おもしろ有機化学ワールド（junk さん） ｜ おもしろ化合物
• 薬品物理化学教室の窓（静岡県立大学薬学部）　動く蛋白質図鑑など
• フェレドキシン ほか（大阪大学蛋白質研究所酵素反応学研究部門）
• アスパラギン酸アミノ基転移酵素／Chime Version（大阪医科大学医化学教室）
• 分子グラフィックスの実例（東京都立大学工業化学科工業物理化学研究室）
  ※参考：東京都立大学工業化学科分子応用科学研究会 編，「材料化学の最前線」，講談社ブルーバックス(1998)
• 「ある化学者の屋根裏部屋」
• 3Dグラフィッククイズ（『ふしぎの国のかがく』）　※2000/12/31〜2001/12/31開催のインパクのイベント
• NCI-3D
• The ATSDR Priority List - S110（Specialized Information Services）
• ATSDR - ToxFAQs
• Molecular Models for Biochemistry at CMU
• RasMol Home Page ｜ Chime Resources at UMass (by Eric Martz)
• Liz Dorland's Chemistry Tutorial and Resource Page
• General Chemistry Online!
• Department of Chemistry, Wellesley College
  • Chemistry 101／UNDERSTANDING DRUGS　CANCERなどQTムービーも用いた教材多数
  • Chemistry 227／Intro To Biochem　REPLICATIONなど
  • Chemistry 341　The Molecule Galleryなど
• Department of Chemistry, Imperial College of Science, Technology and Medicine.
  • 3-D Virtual Chemistry Library - Vchemlib　Molecule Library，Science Museumなど
  • Electronic Conferences on Trends in Organic Chemistry　ECHET98など
• The Macrogalleria　高分子について詳しく学習できます！
• UWI-Mona Chemistry Lectures　Food Additives，flavour mapなど
• IR animations
• Presentation of Vibrational Spectra with Chime ｜ Infrared Spectroscopy Interactive Visualizations
• Visualization and Problem Solving for General Chemistry　Molecule Library，Crystal Structure Library，Vibrational Modes of Small Molecules（「動く分子事典」p.305 参照）など
• Molecules from Chemistry at Okanagan University College　Molecular Shape，Chiral，Molecular Model SearchなどPDB形式分子データ多数！
• Molecular Structures（Cambridge University Chemical Laboratory，WWW Teaching Examples）
• Colby Chemistry Department Information　3D-Molecular Structures，Molecular Structure Calculationsなど
• Molecule of the Month / Bristol
• DCU CHIME Pages　Molecular Galleryなど
• Molecules from Chemistry at Okanagan University College ｜ Introduction to Basic Organic Nomenclature
• Klotho: Alphabetical Compound List
• Library of 3-D Molecular Structures (MathMol)
• WebMolecules　※Chime版とVRML版指定可
• Chemistry: Molecules, Matter, and Change　Structures (PDB Format)，Structures (QuickTimeVR Format)など
• Molecular Modeling Home Page (Lebanon Valley College)
• Molecular Biology Tutorials by Kenyon Students
• Molecular Gallery (Department of Foods and Nutrition, Purdue University)
• General Chemistry (Prentice Hall)
• Chemical Bonds, Molecular Shapes, and Molecular Models
• 3DInSight
• Chemistry Molecular Models (by Dr. Tom Zamis)
• Molecular models
• Malathion Module Homepage　Chime / RasMol: PDB Structure Files，Bio-Molecular Chemical Data Baseなど
• C4: Computers in Chemistry at Cabrillo College

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※ ChemscapeChime を利用したWebページ作成の経緯に関する報告書・資料など
• 「インターネット利用とホームページ開設の歩み（その２）」 ｜ Web版分子事典の利用状況（その１・その２）
• 「情報ネットワークとホームページ『生活環境化学の部屋』」，県立新潟女子短期大学共同研究“インターネットの研究・教育への利用に関する研究”(1998) ｜ 追加資料
• 「化学教育と環境情報流通のためのホームページの公開と活用」，日本化学会第78春季年会特別企画12“インターネットと化学教育”(2000)
• 「インターネットによる知の共有の試み」，化学，2000年５月号，化学同人