◆ 糖タンパク質データ集(Jmol版) ◆
= 糖鎖を含むタンパク質 =
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※糖が結合していないタンパク質(シクロデキストリンを含むものなど)や糖鎖のみのデータ(ヒアルロン酸,シクロアミロースなど)等も含む.[ ] 内は参考キーワードまたは文献[1]の掲載ページ(例: [1-165] は文献[1]のp.165),以下は凡例糖質以外の糖残基例.初期表示は1cqf(志賀毒素).
※2008/03/14,オリジナルデータへのリンクを従来のRCSB PDBから詳しい糖鎖情報を参照できるPDBsumに変更しました(そちらからRCSBなど他のデータベースの個別情報へもリンク)。
※Toll様受容体についてはToll様受容体参照。

1a47PDBsum〉 [シクロデキストリン糖転移酵素,グリコシダーゼ]
1a4gのChain A 〈PDBsum〉 [インフルエンザ治療薬ザナミビル,ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
1ac0PDBsum〉 [グルコアミラーゼ,クロコウジカビ]
1afaPDBsum〉 [1-165]
1agmPDBsum〉 [グルコアミラーゼ-471,クロコウジカビ,アワモリコウジカビ(泡盛麹菌),アクラボス]
1aozのChain A 〈PDBsum〉 [アスコルビン酸オキシダーゼ]
1ax0PDBsum〉 [レクチン,※xylopyranose]
1azxPDBsum〉 [アンチトロンビン]
1bhgのChain A 〈PDBsum〉 [β-グルクロニダーゼ(この欠損症がムコ多糖症 MPS VII型)]
1btc*PDBsum〉 [α-シクロデキストリン]
1bzbPDBsum〉 [カルシトニン]
1c3m*PDBsum〉 [レクチン] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):8量体*
1c58のChain A 〈PDBsum〉 [シクロアミロース]
1capPDBsum〉 [カプセル多糖]
1ckl* Chain A-C Asn49・Asn80選択(A-C鎖)PDBsum〉 [補体制御分子CD46(MCP)]
1cqfPDBsum〉 [志賀毒素] 12 6
1ct1PDBsum〉 [コレラ毒素]
1cvi*PDBsum〉 [前立腺性酸性ホスファターゼ]
1cvnのChain A 〈PDBsum〉 [1-182]
1cvuPDBsum〉 [シクロオキシゲナーゼCOX-2]
1cxfPDBsum〉 [α-シクロデキストリン]
1cxkPDBsum〉 [シクロデキストリン合成酵素]
1d1kPDBsum〉 [Gb3受容体(ベロ毒素受容体)に結合した志賀毒素様毒素]
1d3cPDBsum〉 [シクロデキストリングリコシルトランスフェラーゼ]
1d7wのChain A・C 〈PDBsum
1danPDBsum〉 [組織因子,Molecule of the Month]
1dbnのChain A 〈PDBsum〉 [シアリルラクトース]
1dboPDBsum〉 [コンドロイチン分解酵素,※xylopyranose等]
1dn2*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域]
1dogPDBsum〉 [グルコアミラーゼ]
1dp5*PDBsum〉 [プロテイナーゼA]
1dpj*PDBsum〉 [プロテイナーゼA]
1e03*PDBsum〉 [アンチトロンビンIII]
1e05*PDBsum〉 [アンチトロンビンIII]
1e0o*PDBsum〉 [FGF(線維芽細胞成長因子),FGF1-FGFR2-ヘパリン複合体]
1e4kPDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域とFc-γ受容体]
1e71*PDBsum〉 [ミロシナーゼ(辛味発生酵素)]
1evePDBsum〉 [アセチルコリンエステラーゼ,アルツハイマー病治療薬ドネペジル(アリセプト)]
1f6aPDBsum〉 [IgE抗体のFc領域と高親和性受容体FcεRIのαサブユニット]
1f88のChain A 〈PDBsum〉 [ロドプシン,Molecule of the Month]
1fc1 Asn297選択(A・B鎖)PDBsum
1fcp*PDBsum〉 [大腸菌の内在性膜タンパク質FhuA]
1fcv*PDBsum〉 [ヒアルロニダーゼ] 2 2
1fi1*PDBsum〉 [大腸菌の内在性膜タンパク質FhuA]
1fihPDBsum〉 [プロテインA]
1frtPDBsum〉 [新生ラットのFc受容体とFc領域]
1fv2PDBsum〉 [破傷風毒素,ガングリオシドGT1b]
1fv3のChain B 〈PDBsum〉 [ガングリオシドGT1bに結合した破傷風毒素]
1fzcのChain A・B・C・G・I 〈PDBsum〉 [フィブリン,Molecule of the Month]
1g0v*PDBsum〉 [プロテイナーゼA]
1g1rPDBsum〉 [P-セレクチン]
1g1tPDBsum〉 [1-169]
1g9jPDBsum〉 [セルラーゼ Cel48F]
1g9mPDBsum〉 [HIV-1ウイルスのエンベロープ糖タンパク質gp120,CD4,抗体17b]
1gah acarbose選択PDBsum〉 [グルコアミラーゼ-471,アワモリコウジカビ(泡盛麹菌),アカルボース(α-グルコシダーゼ阻害薬)]
1gai*PDBsum〉 [グルコアミラーゼ-471,アワモリコウジカビ(泡盛麹菌)]
1gcaPDBsum〉 [グルコース/ガラクトース受容体]
1glmPDBsum〉 [グルコアミラーゼ]
1gpePDBsum〉 [グルコースオキシダーゼ]
1gyaのModel 1 Asn65選択PDBsum
1gzwPDBsum〉 [ガレクチン-1,1-150]
1h3v*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域]
1h3x*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域]
1h3yPDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域]
1h4pのChain A*PDBsum〉 [endo-β-1,4-glucanse]
1hd4のModel 1 〈PDBsum〉 [ヒト絨毛性ゴナドトロピン]
1hgg 糖鎖(GAL-GLC-SIA[G])+SITE$PDBsum〉 [ヘマグルチニン;インフルエンザ情報参照]
1hm2PDBsum〉 [※xylopyranose・rhamnose等]
1hzhPDBsum〉 [IgG b12,Molecule of the Month]
1i1a*PDBsum〉 [Fc領域とFc受容体]
1i1cPDBsum〉 [ラットIgG2a抗体のFc領域]
1igt 糖鎖(NAG 1(B) to NAG 9(B))+SITE$ 糖鎖(NAG 1(D) to NAG 9(D))+SITE$PDBsum〉 [IgG2a,Molecule of the Month]
1igyPDBsum〉 [免疫グロブリンIgG1]
1iis*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域とFc-γ受容体]
1iixPDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域とFc-γ受容体]
1ingのChain A*PDBsum〉 [ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
1inhのChain A 〈PDBsum〉 [ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
1inyPDBsum〉 [ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
1itcPDBsum〉 [β-アミラーゼ]
1j8rPDBsum
1jc9PDBsum〉 [タキレクチン] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):4量体
1jsoPDBsum〉 [鳥インフルエンザウイルスのヘマグルチニン(H5型);インフルエンザ情報参照]
1kj2*PDBsum〉 [T細胞受容体,ScFv,MHCクラスI]
1kjlPDBsum〉 [ガレクチン-3,1-150]
1kenのChain A-F 〈PDBsum〉 [ヘマグルチニン;インフルエンザ情報参照]
1l3w*PDBsum〉 [C-カドヘリン,Molecule of the Month] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):2量体*
1l6x*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域,リツキシマブ(リツキサン)]
1l7fPDBsum〉 [ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
1l9hのChain A 〈PDBsum〉 [ロドプシン]
1lgbPDBsum〉 [レクチン-ラクトトランスフェリン複合体]
1lgc*PDBsum〉 [レクチン-ラクトトランスフェリン複合体]
1lohPDBsum〉 [ヒアルロン酸リアーゼ] 3 3
1lt4PDBsum〉 [エンテロトキシン,アジュバント(adjuvant)]
1lte*PDBsum〉 [レクチン]
1ltjのChain A,B,C,G,H 〈PDBsum〉 [フィブリノーゲン]
1lttのChain D-H 〈PDBsum〉 [エンテロトキシン]
1lxm*PDBsum〉 [ヒアルロン酸リアーゼ]
1lzjPDBsum〉 [糖転移酵素,H抗原]
1m1jPDBsum〉 [フィブリノーゲン,Molecule of the Month]
1m5m*PDBsum〉 [シアノビリン-N1(抗ウイルス性タンパク質)]
1mcoPDBsum〉 [IgG1抗体]
1mhlのChain A・C 〈PDBsum
1mw0PDBsum〉 [アミロスクラーゼ]
1mwe*PDBsum〉 [ヘマグルチニン;インフルエンザ情報参照]
1mx5のChain A-C 〈PDBsum〉 [肝カルボキシルエステラーゼ,ホマトロピン(抗コリン薬)]
1myrPDBsum〉 [ミロシナーゼ(辛味発生酵素),グリコシダーゼ]
1n1fPDBsum〉 [インターロイキン-19]
1n7qPDBsum〉 [ヒアルロン酸リアーゼ]
1n7rPDBsum〉 [ヒアルロン酸リアーゼ]
1nn2*PDBsum〉 [A型インフルエンザウイルス(1967年 東京)のノイラミニダーゼ,Molecule of the Month] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):4量体
1nq9*PDBsum〉 [アンチトロンビン]
1o7d*PDBsum〉 [リソソームα-マンノシダーゼ]
1op5 NAG 1(A) to MAN 10(A))+SITE$ Chain Aの糖鎖のみ(Man9GlcNAc2) 〈PDBsum〉 [抗体2G12,HIV-1]
1oqo*PDBsum〉 [Fc領域,プロテインA]
1ow0PDBsum〉 [FcaRI,IgA1-Fc]
1p2g*PDBsum〉 [グリコーゲンホスホリラーゼb,γ-シクロデキストリン]
1p8jPDBsum〉 [プロタンパク質転換酵素フューリン]
1ppiPDBsum〉 [α-アミラーゼ]
1q47のChain A 〈PDBsum〉 [セマフォリン3A(semaphorin-3A;軸索反発因子)]
1q4g(HEMは座標2種のうちAのみ)PDBsum〉 [プロスタグランジンH2シンターゼ]
1q5bPDBsum〉 [カドヘリン]
1qff*PDBsum〉 [大腸菌の内在性膜タンパク質FhuA]
1qfoのChain A 〈PDBsum〉 [シアリルラクトース,1-167]
1qfu*PDBsum〉 [ヘマグルチニン;インフルエンザ情報参照]
1qgiPDBsum〉 [キトサナーゼ]
1qjqPDBsum
1qnuPDBsum〉 [O157,志賀毒素様毒素]
1rnePDBsum〉 [レニン]
1s78のChain A・C・D 〈PDBsum〉 [乳がん治療薬のモノクローナル抗体ペルツズマブ(C・D鎖)]
1slt Chain A 〈PDBsum〉 [1-172]
1sr5*PDBsum〉 [アンチトロンビン-アンヒドロトロンビン-ヘパリン三元複合体]
1t83*PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域とFc-γ受容体]
1t89PDBsum〉 [IgG1抗体のFc領域とFc-γ受容体]
1tb6*PDBsum〉 [アンチトロンビン-トロンビン-ヘパリン三元複合体]
1tl2*PDBsum〉 [タキレクチン]
1tyw*PDBsum〉 [tailspikeタンパク質]
1u19PDBsum〉 [ウシロドプシン,Hg,Zn]
1u65PDBsum〉 [アセチルコリンエステラーゼ,イリノテカン(抗がん剤)]
1ulf 糖鎖(A2G 1(C) to FUC 21(C))+SITE$PDBsum〉 [ガレクチン-2,1-150]
1umi* Phe177・Tyr279・Trp280・Lys281選択PDBsum〉 [糖鎖識別ユビキチン連結酵素;資料(東京都医学研究機構)文献p.232参照]
1vfuのChain A 〈PDBsum〉 [α-アミラーゼ,γ-シクロデキストリン]
1vsg* Asn263選択(A・B鎖)PDBsum〉 [1-106]
1xhbPDBsum
1xmnPDBsum〉 [トロンビン-ヘパリン複合体]
1yk0のModel 1 〈PDBsum〉 [心房性ナトリウム利尿ペプチド(ANP)と受容体]
1yo8PDBsum〉 [トロンボスポンジン,THBS2]
1yy9*PDBsum〉 [上皮成長因子(EGF)受容体,セツキシマブ抗原結合(Fab)フラグメント]
1z2rChain A・B 〈PDBsum〉 [脂質輸送,ABC(ATP-binding cassette)ランスポーター,多剤耐性]
1z32PDBsum〉 [唾液アミラーゼ]
1z6iPDBsum〉 [ペプチドグリカン認識タンパク質(PGRP)-LCa]
1zag*PDBsum
1zlwPDBsum〉 [抗体2G12,HIV-1]
1zntのModel 1 〈PDBsum4-fluoro-L-phenylalanine(PFF)選択 [抗菌タンパク質,キチン]
2adePDBsum〉 [フラクタン(フルクタン)分解酵素]
2b5tPDBsum〉 [アンチトロンビン-トロンビン-ヘパリン三元複合体]
2b8hPDBsum〉 [ノイラミニダーゼ;インフルエンザ情報参照]
2bf1PDBsum〉 [SIV由来の非結合型gp120]
2bvkPDBsum〉 [ヒアルロナン]
2c11のChain A・B*PDBsum〉 [アミンオキシダーゼ]
2c4aPDBsum〉 [ノイラミニダーゼ(N9);インフルエンザ情報参照]
2c5c* 糖鎖(GLA 1070(A) to GLC 1072(A))+SITE$PDBsum〉 [志賀様毒素1型]
2chbPDBsum〉 [コレラ毒素]
2cijPDBsum〉 [グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ II(GCPII)]
2cn3のChain A 〈PDBsum〉 [キシログルカナーゼ]
2d04*PDBsum〉 [味覚修飾タンパク質ネオクリン]
2d0gPDBsum〉 [α-アミラーゼTVAI]
2dqaPDBsum〉 [アサリ(日本種)のリゾチーム,Ptイオン]
2dtwPDBsum〉 [レクチン]
2dtyPDBsum〉 [レクチン]
2dvcPDBsum〉 [ラクトトランスフェリン]
2dw0PDBsum〉 [ガラガラヘビ毒素,アポトーシス]
2dw2PDBsum〉 [ガラガラヘビ毒素,アポトーシス]
2dxyPDBsum〉 [ラクトフェリン,トレハロース]
2e47PDBsum〉 [時計タンパク質EA4]
2e53PDBsum〉 [シカクマメのレクチン,B血液型二糖]
2e7tPDBsum〉 [アグルチニン(凝集素)]
2eaePDBsum〉 [フコシダーゼ;資料(KEK)]
2ehaのChain A 〈PDBsum〉 [ラクトペルオキシダーゼ]
2fcp*PDBsum〉 [大腸菌の内在性膜タンパク質FhuA]
2g87*PDBsum〉 [バソロドプシン]
2h5uPDBsum〉 [ラッカーゼ]
2h6oPDBsum〉 [EBウイルスのエンベロープ糖タンパク質]
2hij*PDBsum〉 [アンチトロンビンIII]
2hloのChain A・B・C・G 〈PDBsum〉 [フィブリン]
2hpy*PDBsum〉 [ルミロドプシン]
2i37PDBsum〉 [ロドプシン]
2i5yのChain G・H・L・M 〈PDBsum〉 [HIV-1ウイルスのエンベロープ糖タンパク質gp120,CD4,抗体17b]
2ibxPDBsum〉 [ヘマグルチニン(H5);インフルエンザ情報参照]
2icnPDBsum〉 [糖タンパク質,プロラクチン誘導タンパク質]
2j25*PDBsum〉 [ゴーシェ病治療薬イミグルセラーゼ(imiglucerase,商品名:セレザイム,Cerezyme)]
2j6e*PDBsum〉 [IgM型リウマトイド(リウマチ)因子,IgG1抗体のFc領域]
2j73PDBsum〉 [プルラナーゼ]
2jcqPDBsum〉 [レクチン,CD44抗原,ヒアルロナン]
2jdnPDBsum〉 [レクチン]
2jenPDBsum〉 [キシログルカナーゼ] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):6量体
2k33のModel 1 〈PDBsum〉 [N-グリコシル化タンパク質]
2msbのChain B 〈PDBsum
2nu5PDBsum〉 [griffithsin]
2nxyPDBsum〉 [HIV-1ウイルスのエンベロープ糖タンパク質gp120,CD4,抗体17b]
2o2lPDBsum〉 [エンテロトキシンB,ABO式血液型抗原]
2oye*PDBsum〉 [シクロオキシゲナーゼ-1(COX-1)]
2pe4PDBsum〉 [ヒアルロニダーゼ-1]
2pedPDBsum〉 [9-cis-ロドプシン]
2pgz コカイン選択PDBsum〉 [コカイン,アセチルコリン受容体-1]
2phwPDBsum〉 [マメ科レクチン]
2pncPDBsum〉 [アミンオキシダーゼ,クロニジン]
2px1PDBsum〉 [ラクトフェリン,ラクトトランスフェリン]
2q7nPDBsum〉 [白血病抑制因子,サイトカイン受容体]
2qad スルホチロシン(Tys)選択PDBsum〉 [HIV-1,gp120,CD4,CCR5,抗体412d]
2qej*PDBsum〉 [IgA1,黄色ブドウ球菌]
2qjrPDBsum〉 [ジペプチジルペプチダーゼIV]
2qpkPDBsum〉 [ラクトペルオキシダーゼ]
2qqmPDBsum〉 [ニューロピリン-1]
2qqu*PDBsum〉 [細胞壁インベルターゼ]
2qrbPDBsum〉 [ラクトペルオキシダーゼ]
2qsc*PDBsum〉 [抗HIV-1抗体]
2qwkPDBsum〉 [GS4071(オセルタミビル〈タミフル〉が変化)が結合したインフルエンザウイルスのノイラミニダーゼ] ‖ 参考データ(PQSによる計算値):4量体
2r61*PDBsum〉 [SSL5,外毒素,シアリルルイスX]
2r7ePDBsum〉 [凝固第VIII因子]
2rftPDBsum〉 [インフルエンザウイルスBのヘマグルチニン,LSTaレセプター]
2ri9PDBsum〉 [マンノシダーゼ]
2rl6PDBsum〉 [マンノース6リン酸レセプター]
2v3fPDBsum〉 [β-グルコシダーゼ]
2v5sPDBsum〉 [ダウン症細胞接着分子(DSCAM]
2vc2*PDBsum〉 [インテグリンαIIbβ3,モノクローナル抗体]
2volPDBsum〉 [TRIM21,IgG抗体のFc領域]
2vuzPDBsum〉 [codakine]
2vxjPDBsum〉 [緑膿菌のPA-ILレクチン]
2z1kのChain D 〈PDBsum〉 [プルラナーゼ,β-シクロデキストリン]
2z55のChain A*PDBsum〉 [アーキロドプシン]
2z5z*PDBsum〉 [ラクトペルオキシダーゼ]
2z62PDBsum〉 [Toll様受容体TLR4]
2z7xPDBsum〉 [Toll様受容体TLR1-TLR2]
2zeyPDBsum〉 [糖質結合モジュール]
2zhmPDBsum〉 [ガレクチン-9]
2zl6PDBsum〉 [ノーウォークウイルス,カプシドタンパク質]
2zmbPDBsum〉 [ラクトトランスフェリン,パレコキシブ(コキシブ系非ステロイド性抗炎症薬;COX-2選択的阻害)]
2zmn*PDBsum〉 [レクチン]
3bc9PDBsum〉 [α-アミラーゼ,糖尿病治療薬アカルボース]
3besPDBsum〉 [インターフェロンγ,エクトロメリアウイルス(ポックスウイルス)]
3bhxPDBsum〉 [グルタミン酸カルボキシペプチダーゼ II(GCPII)]
3bkkPDBsum〉 [アンジオテンシン(アンギオテンシン)変換酵素(ACE)]
3bl8*PDBsum〉 [ニューロリジン(ニューロリギン)]
3bmwPDBsum〉 [シクロデキストリングルカノトランスフェラーゼ]
3bwr*PDBsum〉 [サルウイルス40(SV40,Molecule of the Month),カプシドタンパク質]
3c2sPDBsum〉 [Fc領域,B型肝炎ウイルス受容体結合タンパク質]
3c5xPDBsum〉 [デング2型ウイルス]
3c6sのChain A・B 〈PDBsum〉 [Fab F22-4]
3ca0PDBsum〉 [アグルチニン(凝集素),セイヨウニワトコ]
3cap*PDBsum〉 [ロドプシン,リガンドフリー状態]
3cig*PDBsum〉 [Toll様受容体TLR3]
3ciyPDBsum〉 [Toll様受容体TLR3,二本鎖RNA(dsRNA)]
3cl5PDBsum〉 [ヘマグルチニンエステラーゼ]
3csy(アミノ酸側鎖なし)PDBsum〉 [エボラウイルス]
3cye(座標2種のうちModel 1のみ)PDBsum〉 [インフルエンザウイルス(1918年:スペインかぜ),H1N1,ノイラミニダーゼ]
3d12*PDBsum〉 [ニパーウイルス,エフリンB3]
3d2d*PDBsum〉 [ベルベリン架橋酵素,(S)-レチクリン]
3dgcPDBsum〉 [インターロイキン-22]
3dgvPDBsum〉 [トロンビン活性化線溶抑制因子(TAFI)]
3djyPDBsum〉 [ブチリルコリンエステラーゼ(BChE,偽コリンエステラーゼ),タブン]
3dy0PDBsum〉 [セリンプロテアーゼ阻害タンパク質]
3e0gPDBsum〉 [白血病抑制因子受容体]
3e7jのChain A 〈PDBsum〉 [ヘパリナーゼ(酸性糖鎖分解酵素)]
3evjPDBsum〉 [アンチトロンビンIII]
3es6PDBsum〉 [zinc α-2-glycoprotein(ZAG),プロラクチン誘導タンパク質]
3f6kPDBsum〉 [ニューロテンシンと受容体ソーティリン(ソルチリン)]
3fcsPDBsum〉 [インテグリンαIIbβ3]
3fkxPDBsum〉 [ラクトトランスフェリン,イブプロフェン(非ステロイド性抗炎症薬)]
3fpxPDBsum〉 [ラッカーゼ]
3fxi*PDBsum〉 [Toll様受容体TLR4,リンパ球抗原96]
3gbm*PDBsum〉 [インフルエンザウイルス(H5N1)ヘマグルチニン,ヒト抗体Fab]
3gbpPDBsum〉 [グルコース/ガラクトース受容体]
3ghgPDBsum〉 [フィブリノーゲン(ヒト)]
3glyPDBsum〉 [グルコアミラーゼ]
3gxz*PDBsum〉 [シアノビリン-N(抗ウイルス性タンパク質),HIV,オリゴマンノース-9]
3hwzPDBsum〉 [ラクトトランスフェリン,インドメタシン(酸性非ステロイド性抗炎症薬)]
3hya*PDBsum〉 [ヒアルロン酸(8mer)] 4 4
3w82 [α-L-イズロニダーゼ] 同PDBsumデータ3w82_IDR$ IDR(L-イズロン酸)選択 [Iduronidase - WikipediaIduronic acid - Wikipedia] ※ムコ多糖症のMPS I型と関連。
3wbd 糖鎖(SIA-SIA-SIA-SIA-SIA-SIA-SIA)+SITE$PDBsum〉 [抗ポリシアル酸抗体の単鎖FvフラグメントmAb735,オクタシアル酸結合] [NEW!]
5hmgPDBsum〉 [ヘマグルチニン]


【参考】糖鎖に含まれる単糖の例: Gal(β-D-ガラクトース)|Glc(β-D-グルコース)|Man(β-D-マンノース)|Fuc(α-L-フコース))|Xyl(β-D-キシロース)|Sia(例として N-アセチルノイラミン酸)|GalNAcN-アセチル-D-ガラクトサミン)|GlcNAcN-アセチル-D-グルコサミン)|GlcA(β-D-グルクロン酸)‖以上9分子同時表示(糖別色分け可)|同MDL MOL形式(色分け不可) ‖ 参考:D-グルコサミン(MDL MOL形式)



※本データ集の一部は県立新潟女子短期大学生活科学科生活科学専攻・生活環境化学研究室2006年度ゼミ生の高橋あゆみさんの協力を得ました。

バックボーン 二次構造 | DNA/RNA(ATGCUbackbone
全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 リガンド選択 (*印のみ)
Asn,Ser,Thr選択 | Asn Ser Thr
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色
糖鎖別着色(GalGlcManFucXylSiaGalNAcGlcNAcGlcA単糖構造例参照)
濃赤 濃青  濃ピンク 水色  
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順 コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド#
水素結合(太) OFF 
  背景・黒 灰 白 



参考:1igtChain Dの糖鎖NAG-FUC-NAG-BMA-MAN-NAG-GAL-MAN-NAGとSITE部分
PDBsumより;空間充填は糖鎖が結合しているAsn314)



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