アミノ酸および特性基の親水性・疎水性とコンホメーション選択性
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※1文字アミノ酸記号の欄の色はamino色（Jmol，RasMol共通）

アミノ酸			分子式	CAS番号	疎水性 インデックス	log P	酸性・塩基性	極性・非極性	等電点	コンホメーション 選択性
Arg	R	アルギニン	H2N(=NH)NHC3H6CCH(NH2)COOH	74-79-3	-4.5	-4.20	塩基性	極性（塩基性）	10.76	α
Lys	K	リシン	H2N(CH2)4CH(NH2)COOH	56-87-1	-3.9	-3.05	塩基性	極性（塩基性）	9.74	α
Asp	D	アスパラギン酸	HOOCCH2CH(NH2)COOH	56-84-8	-3.5	-3.89	酸性	極性（酸性）	2.77	−
Asn	N	アスパラギン	H2NCOCH2CH(NH2)COOH	70-47-3	-3.5	-3.82	中性	極性（中性）	5.41	−
Glu	E	グルタミン酸	HOOCCH2CH2CH(NH2)COOH	56-86-0	-3.5	-3.69	酸性	極性（酸性）	3.22	α
Gln	Q	グルタミン	H2NCO-CH2CH2CH(NH2)COOH	56-85-9	-3.5	-3.64	中性	極性（中性）	5.65	α
His	H	ヒスチジン	H2NCH[CH2(C3H3N2)]COOH	71-00-1	-3.2	-3.32	塩基性	極性（塩基性）	7.59	α
Pro	P	プロリン	(C4H8N)-COOH	147-85-3	-1.6	-2.54	中性	非極性（疎水性）	6.30	−
Tyr	Y	チロシン	HO(C6H4)CH2CH(NH2)COOH	60-18-4	-1.3	-2.26	中性	極性（中性）	5.66	β
Trp	W	トリプトファン	(C8H6N)-CH2CH(NH2)COOH	73-22-3	-0.9	-1.05	中性	非極性（疎水性）	5.89	β
Ser	S	セリン	HOCH2CH(NH2)COOH	56-45-1	-0.8	-3.07	中性	極性（中性）	5.68	−
Thr	T	トレオニン	CH3CH(OH)CH(NH2)COOH	72-19-5	-0.7	-2.94	中性	極性（中性）	6.16	β
Gly	G	グリシン	H2NCH2COOH	56-40-6	-0.4	-3.21	中性	非極性（疎水性）	5.97	−
Ala	A	アラニン	CH3CH(NH2)COOH	56-41-7	1.8	-2.85	中性	非極性（疎水性）	6.00	α
Met	M	メチオニン	CH3SCH2CH2CH(NH2)COOH	63-68-3	1.9	-1.87	中性	非極性（疎水性）	5.74	α
Cys	C	システイン	HSCH2CH(NH2)COOH	52-90-4	2.5	-2.49	中性	極性（中性）	5.07	β
Phe	F	フェニルアラニン	(C6H5)CH2CH(NH2)COOH	63-91-2	2.8	-1.38	中性	非極性（疎水性）	5.48	β
Leu	L	ロイシン	(CH3)2CHCH2CH(NH2)COOH	61-90-5	3.8	-1.52	中性	非極性（疎水性）	5.98	α
Val	V	バリン	(CH3)2CHCH(NH2)COOH	72-18-4	4.2	-2.26	中性	非極性（疎水性）	5.96	β
Ile	I	イソロイシン	C2H5CH(CH3)CH(NH2)COOH	73-32-5	4.5	-1.70	中性	非極性（疎水性）	6.02	β

※hydropathy indexは以下を参照；Kyte and Doolittle, J. Mol. Biol., 157, 105-132(1982)
※log PはOn-Line Log P Calculation掲載の実験値
※極性・非極性はChimeのProtein選択様式と関連（参考ページ）
※アミノ酸のコンホメーション選択性は以下による；From Sequence to Structure [PDF]，p.18
《参考》分子と分子の相互作用（QSARと有機概念図から）〔特性基RのI・O値を用いた計算例：1ereのSITE表示と有機概念図計算〕
《参考》１文字アミノ酸配列から各種HTMLデータを作成する秀丸マクロ

図2　疎水性インデックス（hydropathy index）のグラフ

図3　有機概念図のI/O値順に並べたアミノ酸（有機概念図簡易計算機，Log Pをポケットに！参照）

図4　アミノ酸残基のhydropathy indexとI'/O'値の比較（Glyを除く）

図5　芳香族アミノ酸（Phe，Tyr，Trp）；上表の酸性・中性・塩基性区別表示における中性のうち芳香族アミノ酸は黄緑色で表示される．
※参考雑誌記事：青木康展，『ベンゼンはなぜ動物には有害か ─毒性研究を広く自然界を見渡して考える』，科学，2007年9月号，pp.986-989
…p.987の「動物のフェニル基は植物に依存している」に関連して（親油ポテンシャル表示はChime版でのみ可能）；関連資料１・２