※分子モデル表示にはプラグインのChimeが必要です（詳細とダウンロード方法）

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CASTpデータで見るSARSコロナウイルス関連タンパク質
※CASTpは，PDB ID または Keyword Search（例えば SARS など），あるいはデータアップでポケット部位が探索可能なサイトです．

●SARSウイルスのプロテアーゼ1p9s Chain BのCASTpデータから　※参考：Cleftsデータ（全鎖） 　　 Pocket 69構成アミノ酸選択 ｜ Pocket 68構成アミノ酸選択 1p9s Chain B全体とPocket 69（薄緑）・ Pocket 68（薄紫） …初期表示 Chain Bの全ポケットデータ（Chain A間との70・71除く；Pocket 69薄緑・68薄紫，他は黄色） Pocket 69（Area=401.95，Volume=726.65） ＋ DOX 2 ｜ Pocket 69構成アミノ酸残基 ＋ DOX 2 Pocket 68（Area=324.66，Volume=507.47） ＋ MSE 241 ｜ Pocket 68構成アミノ酸残基 ＋ MSE 241 ●同1q2w Chain BのCASTpデータから　※参考：Cleftsデータ（全鎖） 　　 Pocket 60構成アミノ酸選択 ｜ Pocket 59構成アミノ酸選択 1q2w Chain B全体とPocket 60（薄緑）・ Pocket 59（薄紫） Chain Bの全ポケットデータ（Chain A間との61除く；Pocket 60薄緑・59薄紫，他は黄色） Pocket 60（Area=407.74，Volume=1013.34） ｜ Pocket 60構成アミノ酸残基 Pocket 59（Area=243.17，Volume=324.83） ｜ Pocket 59構成アミノ酸残基 ◆CASTpデータを含まないSARS関連データ 2alv ‖ 2cgg ‖ 2ga6のChain A-L ‖ 2gz7 ‖ 2z3c 阻害剤モデル分子等を含むデータ例 2zu4（TG-0204998含む）　※参考：Cleftsデータ，PDBsumによるSITE部分（本サイト） 《 今後データを追加します 》

タンパク質バックボーン 同・二次構造 リガンド表示 OFF 水分子表示（*印データのみ）　 OFF 全選択 リガンド選択 タンパク質選択 空間充填 球棒 球・大き目 スティック OFF CPK色 アミノ色 ｜ 薄緑 薄紫 濃赤 濃青 ラベル表示 OFF ドット表面表示 OFF 静電ポテンシャル OFF 親油ポテンシャル OFF 水素結合（細） 同（太） OFF S-S結合（太） OFF S原子（Protein中）空間充填 光沢表示 OFF ｜ 光量30% OFF 背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー 酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 有機概念図I/O値順（特性基 R）| 同（アミノ酸） 等電点順 ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別 SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP ※疎水性インデックス順 ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※同上（アミノ酸） GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE ※等電点順 ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG