◆ ウナギの蛍光タンパク質“UnaG”(ユーナジー) ◆

“UnaG”関連データ例
※初期表示はPDBデータ 4i3bのChain A(UnaGタンパク質;ビリベルジンが結合)

PDBデータ 4i3bのChain A(UnaGタンパク質/wild type;ビリベルジン〈biliverdin,biliverdine〉が結合) 同PDBsumデータ4i3b_BLA$ I'/O'=0.8085
PDBデータ 4i3cのChain A(UnaGタンパク質/N57Q mutant;ビリベルジン結合) 同PDBsumデータ4i3c_BLA$ I'/O'=0.8878
PDBデータ 4i3dのChain A(UnaGタンパク質/N57A mutant;ビリベルジン結合) 同PDBsumデータ4i3d_BLA$ I'/O'=0.6645

57番残基選択(4i3d_BLA には含まれない)

ビリルビン(bilirubin)

《参考》
ヘム(haem,heme)
PDBデータ 1s8cのChain A(ヘムオキシダーゼ;ビリベルジンが結合) 同PDBsumデータ 1s8c_BLA$


バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択
リガンド選択 BLA(ビリベルジン)選択
(*印のみ) HB選択($印のみ)
Chain A選択 B C D
空間充填 球棒 球40% スティック 針金 消去
アミノ色 Chain色 CPK色 | Jmol色 Rasmol色
濃赤 濃青 

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順
I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示 S-S結合表示 
  
背景・黒 灰 白 



ビリベルジンが結合したUnaGタンパク質4i3b(Chain A)とそのPDBsumデータ



バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 

空間充填 球棒 球60% スティック 針金 消去
アミノ色 Chain色 CPK色 | Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順
I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示 S-S結合表示 
  
背景・黒 灰 白 

発色原子団等の色分け(:発色団,:PHE,:VAL,水色:GLN)
同原子団の選択 | 発色団共役二重結合をピンク表示
 ※ 1HCJ Chain Aの蛍光発生部分



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