◆ 抗がん剤開発と標的タンパク質 ◆
= 分散コンピューティングによるがんの新薬開発 =

→ Jmol版 | 話題の制がん剤・抗がん剤 ←


グリッドコンピューティングによる抗がん剤候補探索で用いられたタンパク質
※初期表示はイマチニブ(商品名グリベック)を含む1iepのChain A
※PDBsumにより PDB ID または 物質名検索 で LIGPLOT情報参照可(作例集参照)。
※CASTpにより,PDB ID 検索あるいはキーワード( cancer など)検索でポケット部位探索可能

821p 《RAS proteins》 ★★
1agwのChain A 《Fibroblast Growth Factor Receptor》 ★
1aq1 《CDK-2》 ★ → リガンド結合部位
1bzh 《Protein-Tyrosine-Phosphatase 1B》 ★
1c1y 《RAF》 ★
1c25 《Catalytic Domain of Cell Cycle Control Phosphatase (Cdc25A)》 ★
1d8d 《Farnesyltransferase》 ★★
1e7u;ワートマニン(wortmannin) 《Phosphatidylinositol 3 Kinase》 ★
1fgiのChain A 《Fibroblast growth factor receptor-1》 ★
1flt 《Vascular Endothelial Growth Factor / VEGFr1》 ★★
1g6h 《BRAF: ADP-Binding transport protein》 ★
1h9o 《Phosphatidylinositol 3 Kinase (alpha)》* ★
1iepのChain A;イマチニブ(商品名グリベック) 《C-ABL Tyrosine Kinase》 ★
1isaのChain A 《Superoxide dismutase》*(Fe近接1分子) ★
1l3eのModel 1 《Hypoxia-inducible factor (HIF-1)》 ★
1m17;エルロチニブ 《Epidermal growth factor receptor》 ★
1nvs 《Chk1》 ★
1o6k 《Protein Kinase B (AKT-2)》 ★
1qb0 《Catalytic Domain of Cell Cycle Control Phosphatase (Cdc25B)》 ★
1rv1 《Human Double Minute 2 (HDM2) with inhibitor》* ★
1sqo 《Urokinase plasminogen activator (uPA)》 ★
2src 《C-SRC Kinase》 ★
1t69 《Histone deacetylase (HDAC)》 ★
1t73 《Androgen receptor (AR)》 ★
1t76 《Androgen receptor (AR)》 ★ ※1t74,1t79,1t7f,1t7m,1t7r,1t7tは略
1uou 《Thymidine Phosphorylase》 ★
1v8k 《Kinesin Kif2C》* ★
1w22のChain A 《Histone deacetylase (HDAC)》* ★
1xjd 《Protein Kinase C Θ》 ★
1ycr 《Human Double Minute 2 (HDM2) bound to p53》 ★
1yet;ゲルダナマイシン 《Heat Shock Protein 90 (Hsp90)》 ★

 ★ Screensaver Lifesaverで用いられた標的タンパク質
 ★ Find-a-Drug: Projects - Cancerで用いられたタンパク質
タンパク質バックボーン 同・二次構造 | DNA/RNA(ATGCU)
リガンド表示 OFF | 水分子表示(*印データのみ)  OFF
全選択 リガンド選択 | タンパク質選択 | DNA/RNA全選択 同・糖&リン酸選択
空間充填 球棒 スティック OFF | 原子色(CPK) amino色 chain色
ラベル表示(アミノ酸) OFF | ドット表面表示 OFF | 光沢表示 OFF
水素結合(細) 同(太) OFF | シスチン結合(太) OFF | S原子(アミノ酸中)空間充填
静電ポテンシャル 同(透明) OFF | 親油ポテンシャル 同(透明) OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白 | 回転 OFF | 画像をクリップボードへコピー

酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 | 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 | log P値順 | 等電点順

《 一部のデータではポテンシャル表示時にエラーになります 》
※amino色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS
 CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE

※等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP
VAL GLY LEU
 ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG



「生活環境化学の部屋」ホームページ | 「分子の形と性質」学習帳 | 話題の制がん剤・抗がん剤