◆ 今週の分子 ◆
★連載55（2004/05/12〜）：シトクロムP450の例（PDBデータ1OG5より）

　体内で解毒などの重要な働きをしているのがユニークな形をしたシトクロムP450ファミリー（Googleによる“cytochrome P450”イメージ検索結果参照）。今週は，以下の講演会で結晶構造解明の重要性に言及されているヒトcytochrome P450（CYP）2C9の例です。

→ 第242回CBI学会研究講演会「Cytochrome P450の分子計算」（2004/05/19開催，東京） ←
※P450関連のコンテンツ例：P450部分データ集／ステロイドホルモンの生合成と代謝

　なお，シトクロムP450は昔放映されたNHKスペシャル『驚異の小宇宙 人体／壮大な化学工場 ＜肝臓＞』（DVDあり；先日，NHK教育TVジュニアスペシャル版放映）で手数の多い円盤のようなCGで登場して強く印象に残っていますが，450nmの光を吸収することから，大阪大学蛋白質研究所の佐藤了名誉教授が命名されたとのことです。


ヒトcytochrome P450（CYP）2C9のPDBデータ例
シアリターゼ（sialidase）分子1og5のChain A
Backbone Termini 2nd Structure
Ligands表示 OFF
Water表示 OFF

Protein選択
Ligand選択 Water選択 全選択
 空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino ｜ ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順（Protein）
log P値順（Protein）
有機概念図I/O値順（Protein特性基 R）| 同（アミノ酸）
Dot Surface表示 OFF
Specular OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※hydropathy index順
ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP
SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
※log P値順
ARG　ASP　ASN　GLU　GLN　HIS　GLY　SER　LYS　THR
ALA　PRO　CYS　VAL　TYR　MET　ILE　LEU　PHE　TRP
※有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS
TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE
※同上（アミノ酸）
GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS
VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE


ヒトcytochrome P450（CYP）2C9の構造例1OG5
〔左〕Chain A全体，〔右〕そのHEME CのSITE部分（PDBデータのLigand結合部位で作成）

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