ポストゲノムを受けてタンパク質の話題が毎日のように流れてきます。2002年の田中耕一さんのノーベル化学賞受賞も関心を高める大きなきっかけになりました。その田中さんへのインタビューやお仕事などの内容などもわかりやすく紹介した以下の本も出版されました。

◎Newton別冊，「タンパク質がわかる本」，ニュートンプレス(2003)

　そこで今週は上記書籍とは関係ありませんが，PDBのタンパク質データの中から珍しい金原子の入ったタンパク質を取り上げます。データの詳細はオリジナルデータをご参照ください。

→ バイオ関連トピックス ←
→ PDBデータのLigand結合部位 ←
※後者コンテンツについては日本コンピュータ化学会2003秋季年会（2003/10/25-26，広島大学）で発表します。

◎金に関する参考文献例：桜井弘，「元素111の新知識」，p.321〜，講談社ブルーバックス(1997)

金の入ったタンパク質例（PDBデータ1HUGのSITE部分） ※黄色表示が金原子（PDBのオリジナルデータ） ※その他のAuが入ったPDBデータリスト

Backbone Termini Ligands表示 OFF Protein選択 Ligand選択 全選択 空間充填 球棒 スティック OFF CPK amino ｜ ラベル表示 OFF 酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 hydropathy index順（Protein） log P値順（Protein） 有機概念図I/O値順（Protein特性基 R）| 同（アミノ酸） Dot Surface表示 OFF Specular OFF ｜ 光量30% OFF 背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF 画像をクリップボードへコピー ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※hydropathy index順 ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE ※log P値順 ARG　ASP　ASN　GLU　GLN　HIS　GLY　SER　LYS　THR ALA　PRO　CYS　VAL　TYR　MET　ILE　LEU　PHE　TRP ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※同上（アミノ酸） GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE

[TOPIC] 2003/08/18，Chime最新版を収録した「動く分子事典」の7刷が発刊されました！