◆ 分子の科学(第4章):分子の構造を決める(b) ◆
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オキシヘモグロビンの部分構造例(PDBデータ1hhoのChain A)
バックボーン 二次構造 DNA/RNA(ATGCU,backbone)
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
DNA/RNA選択 同backbone選択

空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド)
水素結合表示
 
 
背景・黒 灰 白 紺

デオキシヘモグロビンの部分構造例(PDBデータ4hhbのChain A)
バックボーン 二次構造 DNA/RNA(ATGCU,backbone)
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
DNA/RNA選択 同backbone選択

空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド)
水素結合表示
 
 
背景・黒 灰 白 紺


オキシヘモグロビン1hhoのヘム+O2(空間充填)+近接アミノ酸
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
空間充填 球棒 球60%
※参考:Nature 今週のハイライト(2010/06)

デオキシヘモグロビン4hhbのヘム+近接アミノ酸
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
空間充填 球棒 球60%
※参考:Nature 今週のハイライト(2010/06)

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